GEOapplication/xmlftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE294nnn/GSE294832/primaryOK200TranscriptomicsMus musculusExpression profiling by high throughput sequencinghttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE294832GEOGSEfalseModular neuroinflammatory network discovery from large-scale phenotypic screening in genetically heterogeneous mice [part10]The central nervous system represents a uniquely immune-privileged environment, with inflammatory responses involving several resident CNS-specific cell types. While stereotyped cellular and transcriptional responses recur across varied diseases, relevant signaling pathways and regulatory networks are not fully understood. Here, we describe a screening platform based on high-throughput RNA-seq analysis and glial cell state gene set scores that enables multimodal investigation of inflammatory networks at scale. As proof-of-concept, we investigate genetically heterogeneous mice from a large-scale chemical mutagenesis screen to identify novel functionally relevant variants in six genes previously linked to human CNS disorders: Nrros, Ctsd, Smpd1, Idua, Nlrp1a, and Inpp5d . We leverage the rich and readily-interpretable data from our study to demarcate distinct inflammatory states arising from each mutation. In all, our work provides a methodology for discovering novel regulators of CNS neuroimmune homeostasis and provides a validated analysis framework for identifying discrete neuroinflammatory modules that are engaged divergently across disease contexts.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 musculus