GEOTranscriptomicsMus musculusExpression profiling by high throughput sequencinghttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE294911GEOGSEfalseModular neuroinflammatory network discovery from large-scale phenotypic screening in genetically heterogeneous mice [part14]The central nervous system represents a uniquely immune-privileged environment, with inflammatory responses involving several resident CNS-specific cell types. While stereotyped cellular and transcriptional responses recur across varied diseases, relevant signaling pathways and regulatory networks are not fully understood. Here, we describe a screening platform based on high-throughput RNA-seq analysis and glial cell state gene set scores that enables multimodal investigation of inflammatory networks at scale. As proof-of-concept, we investigate genetically heterogeneous mice from a large-scale chemical mutagenesis screen to identify novel functionally relevant variants in six genes previously linked to human CNS disorders: Nrros, Ctsd, Smpd1, Idua, Nlrp1a, and Inpp5d . We leverage the rich and readily-interpretable data from our study to demarcate distinct inflammatory states arising from each mutation. In all, our work provides a methodology for discovering novel regulators of CNS neuroimmune homeostasis and provides a validated analysis framework for identifying discrete neuroinflammatory modules that are engaged divergently across disease contexts.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 musculus