GEOapplication/xmlftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE294nnn/GSE294926/primaryOK200TranscriptomicsMus musculusExpression profiling by high throughput sequencinghttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE294926GEOGSEfalseModular neuroinflammatory network discovery from large-scale phenotypic screening in genetically heterogeneous mice [part15]The central nervous system represents a uniquely immune-privileged environment, with inflammatory responses involving several resident CNS-specific cell types. While stereotyped cellular and transcriptional responses recur across varied diseases, relevant signaling pathways and regulatory networks are not fully understood. Here, we describe a screening platform based on high-throughput RNA-seq analysis and glial cell state gene set scores that enables multimodal investigation of inflammatory networks at scale. As proof-of-concept, we investigate genetically heterogeneous mice from a large-scale chemical mutagenesis screen to identify novel functionally relevant variants in six genes previously linked to human CNS disorders: Nrros, Ctsd, Smpd1, Idua, Nlrp1a, and Inpp5d . We leverage the rich and readily-interpretable data from our study to demarcate distinct inflammatory states arising from each mutation. In all, our work provides a methodology for discovering novel regulators of CNS neuroimmune homeostasis and provides a validated analysis framework for identifying discrete neuroinflammatory modules that are engaged divergently across disease contexts.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 musculus