GEOapplication/xmlftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE294nnn/GSE294968/primaryOK200TranscriptomicsMus musculusExpression profiling by high throughput sequencinghttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE294968GEOGSEfalseModular neuroinflammatory network discovery from large-scale phenotypic screening in genetically heterogeneous mice [part18]The central nervous system represents a uniquely immune-privileged environment, with inflammatory responses involving several resident CNS-specific cell types. While stereotyped cellular and transcriptional responses recur across varied diseases, relevant signaling pathways and regulatory networks are not fully understood. Here, we describe a screening platform based on high-throughput RNA-seq analysis and glial cell state gene set scores that enables multimodal investigation of inflammatory networks at scale. As proof-of-concept, we investigate genetically heterogeneous mice from a large-scale chemical mutagenesis screen to identify novel functionally relevant variants in six genes previously linked to human CNS disorders: Nrros, Ctsd, Smpd1, Idua, Nlrp1a, and Inpp5d . We leverage the rich and readily-interpretable data from our study to demarcate distinct inflammatory states arising from each mutation. In all, our work provides a methodology for discovering novel regulators of CNS neuroimmune homeostasis and provides a validated analysis framework for identifying discrete neuroinflammatory modules that are engaged divergently across disease contexts.2026/04/11GSE294968GSM8933950GSM8933951GSM8933952GSM8933710GSM8933711GSM8933953GSM8933712GSM8933954GSM8933955GSM8933713GSM8933714GSM8933956GSM8933715GSM8933957GSM8933958GSM8933716GSM8933717GSM8933959GSM8933718GSM8933719GSM8933960GSM8933961GSM8933720GSM8933962GSM8933963GSM8933721GSM8933964GSM8933722GSM8933723GSM8933965GSM8933966GSM8933724GSM8933967GSM8933725GSM8933726GSM8933968GSM8933969GSM8933727GSM8933728GSM8933729GSM8933930GSM8933931GSM8933932GSM8933933GSM8933934GSM8933935GSM8933936GSM8933937GSM8933938GSM8933939GSM8933940GSM8933941GSM8933700GSM8933942GSM8933943GSM8933701GSM8933944GSM8933702GSM8933703GSM8933945GSM8933946GSM8933704GSM8933947GSM8933705GSM8933706GSM8933948GSM8933949GSM8933707GSM8933708GSM8933709GSM8933910GSM8933911GSM8933912GSM8933913GSM8933914GSM8933915GSM8933916GSM8933917GSM8933918GSM8933919GSM8933909GSM8933920GSM8933921GSM8933922GSM8933923GSM8933924GSM8933925GSM8933926GSM8933927GSM8933928GSM8933929GSM8933900GSM8933901GSM8933902GSM8933903GSM8933904GSM8933905GSM8933906GSM8933907GSM8933908GSM8934181GSM8934180GSM8934183GSM8934182GSM8934185GSM8934184GSM8934187GSM8934186GSM8934189GSM8934188GSM8934190GSM8934192GSM8934191GSM8934194GSM8934193GSM8934196GSM8934195GSM8934198GSM8934197GSM8934199GSM8934169GSM8934168GSM8934161GSM8934160GSM8934163GSM8934162GSM8934165GSM8934164GSM8934167GSM8934166GSM8934179GSM8934170GSM8934172GSM8934171GSM8934174GSM8934173GSM8934176GSM8934175GSM8934178GSM8934177GSM8933299GSM8934147GSM8934146GSM8934149GSM8934148GSM8933290GSM8933291GSM8933292GSM8934141GSM8933293GSM8933294GSM8934140GSM8933295GSM8934143GSM8933296GSM8934142GSM8933297GSM8934145GSM8934144GSM8933298GSM8934158GSM8934157GSM8934159GSM8934150GSM8934152GSM8934151GSM8934154GSM8934153GSM8934156GSM8934155GSM8933277GSM8934125GSM8934124GSM8933278GSM8933279GSM8934127GSM8934126GSM8934129GSM8934128GSM8933270GSM8933271GSM8933272GSM8933273GSM8934121GSM8933274GSM8934120GSM8933275GSM8934123GSM8933276GSM8934122GSM8933288GSM8934136GSM8934135GSM8933289GSM8934138GSM8934137GSM8934139GSM8933280GSM8933281GSM8933282GSM8934130GSM8933283GSM8934132GSM8933284GSM8933285GSM8934131GSM8933286GSM8934134GSM8934133GSM8933287GSM8933497GSM8934103GSM8934102GSM8933498GSM8934105GSM8933499GSM8934104GSM8934107GSM8934106GSM8934109GSM8934108GSM8933490GSM8933491GSM8933492GSM8933493GSM8933494GSM8934101GSM8933495GSM8933496GSM8934100GSM8933266GSM8934114GSM8934113GSM8933267GSM8933268GSM8934116GSM8934115GSM8933269GSM8934118GSM8934117GSM8934119GSM8933260GSM8933261GSM8933262GSM8934110GSM8933263GSM8934112GSM8933264GSM8933265GSM8934111GSM8933475GSM8933476GSM8933477GSM8933478GSM8933479GSM8933470GSM8933471GSM8933472GSM8933473GSM8933474GSM8933486GSM8933487GSM8933488GSM8933489GSM8933480GSM8933481GSM8933482GSM8933483GSM8933484GSM8933485GSM8933695GSM8933453GSM8933454GSM8933696GSM8933697GSM8933455GSM8933698GSM8933456GSM8933457GSM8933699GSM8933458GSM8933459GSM8933690GSM8933691GSM8933692GSM8933450GSM8933451GSM8933693GSM8933694GSM8933452GSM8933464GSM8933465GSM8933466GSM8933467GSM8933468GSM8933469GSM8933460GSM8933461GSM8933462GSM8933463GSM8933431GSM8933673GSM8933674GSM8933432GSM8933675GSM8933433GSM8933434GSM8933676GSM8933677GSM8933435GSM8933678GSM8933436GSM8933437GSM8933679GSM8933438GSM8933439GSM8933670GSM8933671GSM8933672GSM8933430GSM8933442GSM8933684GSM8933443GSM8933685GSM8933686GSM8933444GSM8933445GSM8933687GSM8933446GSM8933688GSM8933689GSM8933447GSM8933448GSM8933449GSM8933680GSM8933681GSM8933440GSM8933682GSM8933683GSM8933441GSM8933651GSM8933893GSM8933652GSM8933410GSM8933894GSM8933411GSM8933895GSM8933653GSM8933654GSM8933412GSM8933896GSM8933897GSM8933655GSM8933413GSM8933414GSM8933898GSM8933656GSM8933657GSM8933415GSM8933899GSM8933658GSM8933416GSM8933417GSM8933659GSM8933418GSM8933419GSM8933890GSM8933891GSM8933892GSM8933650GSM8933420GSM8933662GSM8933663GSM8933421GSM8933422GSM8933664GSM8933423GSM8933665GSM8933666GSM8933424GSM8933425GSM8933667GSM8933668GSM8933426GSM8933669GSM8933427GSM8933428GSM8933429GSM8933660GSM8933661GSM8933871GSM8933872GSM8933630GSM8933631GSM8933873GSM8933632GSM8933874GSM8933875GSM8933633GSM8933634GSM8933876GSM8933877GSM8933635GSM8933878GSM8933636GSM8933637GSM8933879GSM8933638GSM8933639GSM8933870GSM8933640GSM8933882GSM8933883GSM8933641GSM8933884GSM8933400GSM8933642GSM8933643GSM8933401GSM8933885GSM8933402GSM8933886GSM8933644GSM8933403GSM8933887GSM8933645GSM8933646GSM8933404GSM8933888GSM8933405GSM8933889GSM8933647GSM8933648GSM8933406GSM8933649GSM8933407GSM8933408GSM8933409GSM8933880GSM8933881GSM8933850GSM8933851GSM8933852GSM8933610GSM8933611GSM8933853GSM8933612GSM8933854GSM8933855GSM8933613GSM8933614GSM8933856GSM8933857GSM8933615GSM8933858GSM8933616GSM8933617GSM8933859GSM8933618GSM8933619GSM8933860GSM8933861GSM8933620GSM8933862GSM8933863GSM8933621GSM8933864GSM8933622GSM8933623GSM8933865GSM8933866GSM8933624GSM8933867GSM8933625GSM8933626GSM8933868GSM8933869GSM8933627GSM8933628GSM8933629GSM8933830GSM8933831GSM8933832GSM8933833GSM8933834GSM8933835GSM8933836GSM8933837GSM8933838GSM8933839GSM8933840GSM8933841GSM8933600GSM8933842GSM8933843GSM8933601GSM8933844GSM8933602GSM8933603GSM8933845GSM8933846GSM8933604GSM8933847GSM8933605GSM8933606GSM8933848GSM8933849GSM8933607GSM8933608GSM8933609GSM8933810GSM8933811GSM8933812GSM8933813GSM8933814GSM8933815GSM8933816GSM8933817GSM8933818GSM8933819GSM8933820GSM8933821GSM8933822GSM8933823GSM8933824GSM8933825GSM8933826GSM8933827GSM8933828GSM8933829GSM8933800GSM8933801GSM8933802GSM8933803GSM8933804GSM8933805GSM8933806GSM8933807GSM8933808GSM8933809GSM8934080GSM8934082GSM8934081GSM8934084GSM8934083GSM8934086GSM8934085GSM8934088GSM8934087GSM8934089GSM8934091GSM8934090GSM8934093GSM8934092GSM8934095GSM8934094GSM8934097GSM8934096GSM8934099GSM8934098GSM8934069GSM8934060GSM8934062GSM8934061GSM8934064GSM8934063GSM8934066GSM8934065GSM8934068GSM8934067GSM8934071GSM8934070GSM8934073GSM8934072GSM8934075GSM8934074GSM8934077GSM8934076GSM8934079GSM8934078GSM8934048GSM8934047GSM8934049GSM8934040GSM8934042GSM8934041GSM8934044GSM8934043GSM8934046GSM8934045GSM8934059GSM8934058GSM8934051GSM8934050GSM8934053GSM8934052GSM8934055GSM8934054GSM8934057GSM8934056GSM8934026GSM8934025GSM8934028GSM8934027GSM8934029GSM8934020GSM8934022GSM8934021GSM8934024GSM8934023GSM8934037GSM8934036GSM8934039GSM8934038GSM8934031GSM8934030GSM8934033GSM8934032GSM8934035GSM8934034GSM8934004GSM8933398GSM8934246GSM8934003GSM8933399GSM8934245GSM8934006GSM8934248GSM8934247GSM8934005GSM8934008GSM8934007GSM8934249GSM8934009GSM8933390GSM8933391GSM8933392GSM8934240GSM8933393GSM8933394GSM8934242GSM8934000GSM8934241GSM8933395GSM8934244GSM8934002GSM8933396GSM8934001GSM8933397GSM8934243GSM8934015GSM8934257GSM8934256GSM8934014GSM8934259GSM8934017GSM8934258GSM8934016GSM8934019GSM8934018GSM8934251GSM8934250GSM8934253GSM8934011GSM8934252GSM8934010GSM8934255GSM8934013GSM8934012GSM8934254GSM8934224GSM8933376GSM8933377GSM8934223GSM8933378GSM8934226GSM8933379GSM8934225GSM8934228GSM8934227GSM8934229GSM8933370GSM8933371GSM8933372GSM8934220GSM8933373GSM8933374GSM8934222GSM8934221GSM8933375GSM8934235GSM8933387GSM8933388GSM8934234GSM8933389GSM8934237GSM8934236GSM8934239GSM8934238GSM8933380GSM8933381GSM8933382GSM8933383GSM8934231GSM8934230GSM8933384GSM8933385GSM8934233GSM8934232GSM8933386GSM8933354GSM8934202GSM8933596GSM8933597GSM8934201GSM8933355GSM8933356GSM8934204GSM8933598GSM8933357GSM8934203GSM8933599GSM8933358GSM8934206GSM8933359GSM8934205GSM8934208GSM8934207GSM8934209GSM8933590GSM8933591GSM8933592GSM8933350GSM8933351GSM8933593GSM8933594GSM8933352GSM8934200GSM8933595GSM8933353GSM8933365GSM8934213GSM8934212GSM8933366GSM8934215GSM8933367GSM8933368GSM8934214GSM8933369GSM8934217GSM8934216GSM8934219GSM8934218GSM8933360GSM8933361GSM8933362GSM8933363GSM8934211GSM8934210GSM8933364GSM8933574GSM8933332GSM8933575GSM8933333GSM8933334GSM8933576GSM8933577GSM8933335GSM8933336GSM8933578GSM8933337GSM8933579GSM8933338GSM8933339GSM8933570GSM8933571GSM8933572GSM8933330GSM8933331GSM8933573GSM8933585GSM8933343GSM8933586GSM8933344GSM8933345GSM8933587GSM8933588GSM8933346GSM8933589GSM8933347GSM8933348GSM8933349GSM8933580GSM8933581GSM8933340GSM8933582GSM8933583GSM8933341GSM8933342GSM8933584GSM8933794GSM8933552GSM8933310GSM8933311GSM8933795GSM8933553GSM8933554GSM8933312GSM8933796GSM8933797GSM8933555GSM8933313GSM8933314GSM8933798GSM8933556GSM8933557GSM8933315GSM8933799GSM8933316GSM8933558GSM8933317GSM8933559GSM8933318GSM8933319GSM8933790GSM8933791GSM8933792GSM8933550GSM8933551GSM8933793GSM8933563GSM8933321GSM8933322GSM8933564GSM8933565GSM8933323GSM8933566GSM8933324GSM8933325GSM8933567GSM8933568GSM8933326GSM8933569GSM8933327GSM8933328GSM8933329GSM8933560GSM8933561GSM8933320GSM8933562GSM8933772GSM8933530GSM8933531GSM8933773GSM8933774GSM8933532GSM8933775GSM8933533GSM8933534GSM8933776GSM8933777GSM8933535GSM8933778GSM8933536GSM8933537GSM8933779GSM8933538GSM8933539GSM8933770GSM8933771GSM8933783GSM8933541GSM8933300GSM8933784GSM8933542GSM8933543GSM8933301GSM8933785GSM8933302GSM8933786GSM8933544GSM8933545GSM8933303GSM8933787GSM8933546GSM8933304GSM8933788GSM8933305GSM8933789GSM8933547GSM8933548GSM8933306GSM8933549GSM8933307GSM8933308GSM8933309GSM8933780GSM8933781GSM8933540GSM8933782GSM8933992GSM8933750GSM8933993GSM8933751GSM8933752GSM8933510GSM8933994GSM8933995GSM8933511GSM8933753GSM8933754GSM8933996GSM8933512GSM8933755GSM8933513GSM8933997GSM8933514GSM8933998GSM8933756GSM8933757GSM8933515GSM8933999GSM8933758GSM8933516GSM8933517GSM8933759GSM8933518GSM8933519GSM8933990GSM8933991GSM8933761GSM8933520GSM8933762GSM8933763GSM8933521GSM8933764GSM8933522GSM8933523GSM8933765GSM8933766GSM8933524GSM8933525GSM8933767GSM8933526GSM8933768GSM8933769GSM8933527GSM8933528GSM8933529GSM8933760GSM8933970GSM8933971GSM8933972GSM8933730GSM8933731GSM8933973GSM8933732GSM8933974GSM8933975GSM8933733GSM8933734GSM8933976GSM8933735GSM8933977GSM8933978GSM8933736GSM8933737GSM8933979GSM8933738GSM8933739GSM8933981GSM8933740GSM8933982GSM8933983GSM8933741GSM8933500GSM8933984GSM8933742GSM8933743GSM8933985GSM8933501GSM8933986GSM8933502GSM8933744GSM8933503GSM8933987GSM8933745GSM8933746GSM8933504GSM8933988GSM8933505GSM8933989GSM8933747GSM8933506GSM8933748GSM8933749GSM8933507GSM8933508GSM8933509GSM893398024247294968Mus musculus