GEOapplication/xmlftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE294nnn/GSE294983/primaryOK200TranscriptomicsMus musculusExpression profiling by high throughput sequencinghttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE294983GEOGSEfalseModular neuroinflammatory network discovery from large-scale phenotypic screening in genetically heterogeneous mice [part20]The central nervous system represents a uniquely immune-privileged environment, with inflammatory responses involving several resident CNS-specific cell types. While stereotyped cellular and transcriptional responses recur across varied diseases, relevant signaling pathways and regulatory networks are not fully understood. Here, we describe a screening platform based on high-throughput RNA-seq analysis and glial cell state gene set scores that enables multimodal investigation of inflammatory networks at scale. As proof-of-concept, we investigate genetically heterogeneous mice from a large-scale chemical mutagenesis screen to identify novel functionally relevant variants in six genes previously linked to human CNS disorders: Nrros, Ctsd, Smpd1, Idua, Nlrp1a, and Inpp5d . We leverage the rich and readily-interpretable data from our study to demarcate distinct inflammatory states arising from each mutation. In all, our work provides a methodology for discovering novel regulators of CNS neuroimmune homeostasis and provides a validated analysis framework for identifying discrete neuroinflammatory modules that are engaged divergently across disease contexts.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 musculus