GEOTranscriptomicsMus musculusExpression profiling by high throughput sequencinghttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE294988GEOGSEfalseModular neuroinflammatory network discovery from large-scale phenotypic screening in genetically heterogeneous mice [part21]The central nervous system represents a uniquely immune-privileged environment, with inflammatory responses involving several resident CNS-specific cell types. While stereotyped cellular and transcriptional responses recur across varied diseases, relevant signaling pathways and regulatory networks are not fully understood. Here, we describe a screening platform based on high-throughput RNA-seq analysis and glial cell state gene set scores that enables multimodal investigation of inflammatory networks at scale. As proof-of-concept, we investigate genetically heterogeneous mice from a large-scale chemical mutagenesis screen to identify novel functionally relevant variants in six genes previously linked to human CNS disorders: Nrros, Ctsd, Smpd1, Idua, Nlrp1a, and Inpp5d . We leverage the rich and readily-interpretable data from our study to demarcate distinct inflammatory states arising from each mutation. In all, our work provides a methodology for discovering novel regulators of CNS neuroimmune homeostasis and provides a validated analysis framework for identifying discrete neuroinflammatory modules that are engaged divergently across disease contexts.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 musculus