Metabolite annotation was accomplished by comparing precise molecular weight, secondary fragment spectra and characteristic retention time with multiple public databases including HMDB, METLIN, KEGG and self-built plant metabolite library. Qualitative identification was confirmed according to mass error tolerance and fragment ion matching degree, followed by metabolic pathway enrichment analysis.
"],"repository":["MetaboLights"],"study_status":["Public"],"ptm_modification":[""],"instrument_platform":["Liquid Chromatography MS - negative - reverse-phase","Liquid Chromatography MS - positive - reverse-phase"],"chromatography_protocol":["Parameter Value[Chromatography Instrument]: Agilent 1290 Infinity Ultra High Performance Liquid ChromatographyParameter Value[Autosampler model]: Agilent 1290 Standard AutosamplerParameter Value[Column model]: Waters ACQUITY UPLC HSS T3 Column (1.8 μm, 2.1 mm × 100 mm)Parameter Value[Guard column]: Waters HSS T3 VanGuard Pre-column (1.8 μm, 2.1 mm × 5 mm)
"],"publication":["Metabolomic responses of Solanum lycopersicum to Tuta absoluta infestation and TaCRVP effector expression."],"submitter_affiliation":["Fujian Agriculture and Forestry University"],"submitter_name":["Jianquan Yan"],"organism_part":["leaf"],"technology_type":["mass spectrometry assay"],"disease":[""],"extraction_protocol":["The frozen tomato leaf samples were ground thoroughly under low temperature. Metabolites were extracted using ice-cold organic extraction solution via vortex mixing and ultrasonic-assisted extraction. After high-speed refrigerated centrifugation, the supernatant was collected, concentrated and redissolved. The resulting solution was centrifuged again and filtered through microporous membrane for subsequent UHPLC-MS/MS detection.
"],"organism":["Solanum lycopersicum"],"full_dataset_link":["https://www.ebi.ac.uk/metabolights/MTBLS14509"],"author":["Youming Hou. Fujian Agriculture and Forestry University. ymhou@fafu.edu.cn.","Jianquan Yan. yanjq3018@126.com."],"data_transformation_protocol":["Original mass spectrometry raw data were imported into Progenesis QI software for peak matching, retention time alignment, peak identification and data normalization. Unreliable low-quality peaks were eliminated. PCA and OPLS-DA were performed to screen differentially expressed metabolites among experimental groups of tomato leaves.
"],"study_factor":["Treatment"],"submitter_email":["yanjq3018@126.com"],"sample_collection_protocol":["Fresh leaf tissues of Solanum lycopersicum were rapidly collected and cleaned to remove surface impurities. All leaf samples were immediately frozen in liquid nitrogen to terminate metabolic reactions, then preserved at −80 °C in a refrigerator until untargeted metabolomics analysis.
"],"omics_type":["Metabolomics"],"study_design":["Plant Defense Against Herbivory","Metabolomics","untargeted analysis","Solanum lycopersicum","XCMS","experimental blank","Novogene Bioinformatics Institute","Agilent 1290 Infinity HPLC","leaf","AB SCIEX TripleTOF 6600"],"curator_keywords":["Plant Defense Against Herbivory","Metabolomics","untargeted analysis","Solanum lycopersicum","XCMS","experimental blank","Novogene Bioinformatics Institute","Agilent 1290 Infinity HPLC","leaf","AB SCIEX TripleTOF 6600"],"mass_spectrometry_protocol":["Parameter Value[Scan m/z range]: 60–1000 m/zParameter Value[Instrument]: AB Sciex TripleTOF 6600 Mass SpectrometerParameter Value[Ion source]: Electrospray Ionization (ESI), positive and negative ion modesParameter Value[Mass analyzer]: Time-of-Flight (TOF)
"],"metabolite_name":["Riboflavin","Dehydrooreadone","Callicarpenal","Methyl haplodesertoate","Butyl isobutyl phthalate","MG(18:2(9Z,12Z)/0:0/0:0)[rac]","Nicotinic acid riboside","cis-11,14-Eicosadienoic acid","Cycloschkuhriadiol acetate","N-trans-p-coumaroyloctopamine","Woodhousin","DL-Threonine","Methyl 15-acetoxy-7-labden-17-oate","H-Val-Glu-OH","1,5-Naphthalenediamine","(Z)-2-octylpent-2-enedioic acid","L-Proline","Beta-asarone","Lys Leu Asp","3-Hydroxy-3-methylglutarate","Tofacitinib","Labienoxime","2'-Amino-2'-deoxyadenosine","(-)-Sonchuside G","Nordercitin","Safracin A","Ser Glu Glu","(+)-Musacine A","Prostaglandin E1","S-Methyl-methionine","sterculynic acid","H-Leu-Asn-OH","alpha-Methylstyrene","(25R)-3beta,4beta-dihydroxycholest-5-en-26-al","PA(18:3(6Z,9Z,12Z)/20:5(7Z,9Z,11E,13E,17Z)-3OH(5,6,15))","4-Methylene-L-glutamine","2-Hydroxy-3-phenylpropenoate","icosasphinganine","Adenine monohydrochloride hemihydrate","Thr Leu","(9Z,12E)-15,16-dihydroxyoctadeca-9,12-dienoic acid","Morin","6E-Geranylgeraniol-19-oic acid-1-O-methyl ether","Methyl 2-acetyltormentate","17beta-(Acetylthio)estra-1,3,5(10)-trien-3-ol acetate","6-cis-Docosenamide","1-Monopalmitin","Neurymenolide B","gamma-Glutamylphenylalanine","CDP-DG(18:0/20:3(5Z,11Z,14Z)-O(8,9))","Farnesol","Oleamide","(1R,6R)-6-Hydroxy-2-succinylcyclohexa-2,4-diene-1-carboxylate","3-(2-Hydroxyphenyl)propanoic acid","Ala-Leu-Leu-Asp","Fugaxin","Sulpinine A","2'-Epiisotriptiliocoumarin","Fomlactone B","Vindoline","Isopongaflavone","Ulipristal acetate","(+/-)-Abscisic acid","(+)-Isoaminobisabolenol a","Erucic acid","Esprocarb","N-Pivaloylaniline","SM(d19:1/20:5(6E,8Z,11Z,14Z,17Z)-OH(5))","Fabianine","(+)-Cedronellone","Abbeymycin","Succinyladenosine","4,5-Dimethoxy-3,3',4'-trihydroxybibenzyl","1,3-dihydroxypropan-2-yl (9E,12E,15E)-octadeca-9,12,15-trienoate","Phlegmariurine A","Canthaxanthin","(+)-Sophoranol N-oxide","stellatic aldehyde","Acrovestone","Tyr Gln Phe","Hexadecanedioic acid","LysoPE(0:0/20:5(5Z,8Z,11Z,14Z,17Z))","Aminobutyl benzamide","Plakortolide K","alpha-Cyclogeraniol acetate","Gln Trp Trp","Lanyuamide III","Prostaglandin D2","4-Methoxybenzaldehyde","Bellendine","Ketobemidone","Dehydrotomatine","Mono(1-ethylhexyl) phthalate","Androstanediol-17g","Tehranolide","Pentamethoxyacetophenone","H-LEU-LEU-ALA-OH","Makaluvamine A","feruloylagmatine","CDP-DG(20:2(11Z,14Z)/18:2(9Z,11E)+=O(13))","D-Mannosamine","Vitamin B5","Emetamine","3-Methyladenine","Isocurcumenol","Indole","Indole-3-carbinol","MG(0:0/18:1(9Z)/0:0)","Halaminol C","Pro Ile Ala","4,4'-Diapolycopenedial","beta-Ionone","Olivetol","Litseakolide B","Cinmethylin","Obacunone","3,7-Dimethyl-2,5-octadiene-1,7-diol","Loliolide","13-OxoODE","Adenosine","(1S-cis)-4-[2,2-Dimethyl-3-(4-methyl-3-furanyl)cyclopropyl]-2-butanone","(+)-trans-alpha-Irone","Lagochilin","Pumiliotoxin 251D","Tomatidine","Halisphingosine A","(13S,14S)-epoxymaresin","Linoleic 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Arg","Sclareolide","Ambroxide","2,7-Dihydroxy-3-isopropyl-2,4,6-cycloheptatrienone","Clotrimazole","Phenylacetaldehyde","Sinensol F","LysoPE(0:0/16:0)","Thymol glucoside","PA(20:1(11Z)/22:5(4Z,7Z,10Z,13Z,19Z)-O(16,17))","Ruspolinone","Artomunoisoxanthone","6alpha-Angeloyloxy-4alpha-hydroxy-3,4,13,14-tetrahydrokolavenic acid","3-Methoxyanthranilate","Palythoalone B","Guanine","Bombykol","H-D-Tyr-val-gly-OH","Octadecylamine","5'-Methylthioadenosine","Leukotriene D4 methyl ester","DEHP","Darlingine","2-Palmitoylglycerol","SM(d18:0/20:4(5Z,8Z,11Z,14Z)-OH(19S))","Dilept","Cyclolinopeptide D","2,4,6-Triethyl-1,3,5-trithiane","C16 Sphinganine","Leucylarginine","Spirostan","Depdecin","Microsporin B","trans-Ferulic acid","Tecostanine","3E,5E-tridecadienoic acid","(8S)-8-Amino-7-oxononanoylcarnitine","Piscrocin G","Methyl alpha-Eleostearate","Stearidonic Acid","Sorbitan oleate","Hispaglabridin A","Bicyclo[4.2.0]octa-1,3,5-triene","Cortisol","3beta-Fluoro-5beta-pregnan-20-one","H-Val-Leu-OH","1-(beta-D-Ribofuranosyl)-1,4-dihydronicotinamide","Nortricycloekasantalic acid","25-O-Methylcimigenol","Bruceine D","Brunfelsamidine","Ilekudinoside J","Acanthomine A","Heptadecatrienal","cis-10-Heptadecenoic acid","N-Stearoyl Methionine","Dihydrotetrodecamycin","homo-Plakotenin","8-Azabicyclo[3.2.1]octane","Hericenone C","Artelastochromene","Furcatoside C","Abacavir","PA(20:1(11Z)/22:6(4Z,7Z,10Z,13Z,16Z,19Z))","Tryptophol","Homostachydrine","L-Lysine","3beta,4alpha-Dihydroxy-13beta-methoxylupanine","Rubipodanone A","5beta-cholestan-3alpha,7alpha,12alpha,24(S)-tetrol","N-Methylcorydaldine","Hexadecasphinganine","Phe Gly","tetradec-5-ynoic acid","Montiporyne F","Octylamine","Sphinganine","Spathulenol","Dysinosin D","Xenimanadin C","Consiculine","14-Deoxyandrographolide","Dehydrocarvacrol","Metoprolol","Allanxanthone B","4-Hydroxybenzyl alcohol","9-Oxo-10,12-octadecadienoic 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3-phosphate","Azacyclotridecan-2-one","(3'Z,5'Z)-Celaxanthin","Blonanserin","Arg Phe Thr","Hexadecanoylpyrrolidine","2-Amino-1-phenylethanol","Cathafuran A","Glycidyl stearate","Biotin sulfone","10-Deacetoxybarbilycopodin","Estrane","PGP(18:0/16:1(9Z))","Gitogenin","(6R,9S)-3-Oxo-alpha-ionol beta-D-glucoside","4,8 dimethylnonanoyl carnitine","L-Valine","Andrachcinidine","7-O-Demethyl-18-hydroxy-albocycline","Ser Ile Phe","Nicotianamine","Gein","Hippuristerone K","LysoPC(18:3(6Z,9Z,12Z)/0:0)","Indolelactic acid","Arg-Pro-Pro-Gly-Phe-Ser-Pro","5-Hydroxy-8-methoxycalamenene","Pentadecanolide","Phytosphingosine","3-Deoxyestradiol","16-Heptadecyne-1,2,4-triol","Cytosine","Indoleacrylic acid","D-Fructofuranose 1,2':2,3'-dianhydride","Clopenthixol decanoate","Trp Glu Ile","Kermadecin H","Dichotomine B","Nitramine","Bisphenol A bis(2-hydroxyethyl)ether","11beta-Hydroxyandrosterone","Fumigatonin","Methyl 3,4-dihydronidorellaurinate","Corymbi-7,13E-dienolide","Lauramine oxide","Paradol","Broussonetinine B","Calealactone B","LysoPC(18:2(9Z,12Z)/0:0)","(3R)-3,21-dihydroxyhenicosanoic acid","Pelletierine","L-Arginine","gamma-Linolenic acid","Ficusin B","5-Hydroxyisourate","7alpha,12alpha-Dihydroxy-3-oxochol-4-enoate","Tumonoic Acid B","alpha-Linolenic acid","(-)-10-Methoxyvincamedine N-oxide","Phenylethylamine","His Ala Gln","3-(4-Methyl-3-pentenyl)thiophene","Terminaline","Triptolide","N-Hexanoyl-L-homoserine lactone","N6,N6,N6-Trimethyl-L-lysine","Subamolide C","Hongdoushan A","Spirasine IX","Mycaleoxime","Ajubractin D","4-Heptyloxybenzoic acid","Capsi-amide","N6-Threonylcarbamoyladenosine","H-Ile-Gln-OH","[R-(E)]-4-(4-Methyl-3-cyclohexen-1-yl)-3-penten-2-one","Strobilol C","Dimethylglycine","Vinylamycin","Val Ile Leu","PC(22:6(4Z,7Z,10Z,13Z,16Z,19Z)/15:0)","PA(18:3(9Z,12Z,15Z)/0:0)","4,4-Difluoropregn-5-ene-3,20-dione","Ala Val Phe","2alpha,9beta-Dihydroxy-3beta,8beta-oxido-1(15)-trinervitene","LysoPE(18:2w6/0:0)","Diprotin 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To elucidate how this effector manipulates host immunity at the metabolic level, we performed untargeted LC-MS analysis.The study aimed to investigate the metabolic reprogramming induced by the insect salivary effector TaCRVP. The metabolomic results demonstrate a significant downregulation of precursor pathways for jasmonate (JA) synthesis in TaCRVP-OE lines. These metabolic signatures strongly indicate that the TaCRVP effector actively subverts plant oxidative defenses and effectively dismantles the downstream JA-mediated defense network to facilitate insect adaptation.","dates":{"publication":"2026-05-18","submission":"2026-05-18"},"accession":"MTBLS14509","cross_references":{"KEGG":["Com_471_neg","Com_517_neg","Com_378_neg","Com_482_neg","Com_257_neg","Com_542_neg","Com_462_neg","Com_313_neg","Com_99_neg","Com_174_neg","Com_299_neg","Com_403_neg","Com_390_neg","Com_430_neg","Com_300_neg","Com_432_neg","Com_493_neg","Com_229_neg","Com_466_neg","Com_31_neg","Com_90_neg","Com_458_neg","Com_298_neg","Com_500_neg","Com_144_neg","Com_492_neg","Com_438_neg","Com_311_neg","Com_506_neg","Com_486_neg","Com_400_neg","Com_1_neg","Com_69_neg","Com_213_neg","Com_231_neg","Com_417_neg","Com_45_neg","Com_371_neg","Com_36_neg","Com_11_neg","Com_233_neg","Com_176_neg","Com_412_neg","Com_193_neg","Com_44_neg","Com_285_neg","Com_297_neg","Com_308_neg","Com_249_neg","Com_534_neg","Com_419_neg","Com_81_neg","Com_153_neg","Com_499_neg","Com_194_neg","Com_456_neg","Com_17_neg","Com_443_neg","Com_281_neg","Com_336_neg","Com_185_neg","Com_166_neg","Com_541_neg","Com_386_neg","Com_207_neg","Com_210_neg","Com_49_neg","Com_7_neg","Com_86_neg","Com_30_neg","Com_42_neg","Com_83_neg","Com_57_neg","Com_164_neg","Com_52_neg","Com_137_neg","Com_178_neg","Com_80_neg","Com_115_neg","Com_159_neg","Com_51_neg","Com_244_neg","Com_46_neg","Com_179_neg","Com_296_neg","Com_414_neg","Com_171_neg","Com_59_neg","Com_276_neg","Com_435_neg","Com_156_neg","Com_8_neg","Com_408_neg","Com_82_neg","Com_50_neg","Com_39_neg","Com_120_neg","Com_3_neg","Com_148_neg","Com_245_neg","Com_27_neg","Com_47_neg","Com_24_neg","Com_28_neg","Com_117_neg","Com_101_neg","Com_340_neg","Com_488_neg","Com_225_neg","Com_121_neg","Com_269_neg","Com_65_neg","Com_342_neg","Com_192_neg","Com_9_neg","Com_265_neg","Com_74_neg","Com_450_neg","Com_142_neg","Com_10_neg","Com_23_neg","Com_208_neg","Com_343_neg","Com_601_neg","Com_1100_neg","Com_1562_neg","Com_1898_neg","Com_1671_neg","Com_2460_neg","Com_2528_neg","Com_633_neg","Com_2067_neg","Com_1015_neg","Com_962_neg","Com_815_neg","Com_1495_neg","Com_991_neg","Com_1718_neg","Com_2655_neg","Com_2663_neg","Com_1344_neg","Com_1684_neg","Com_1533_neg","Com_1716_neg","Com_605_neg","Com_1766_neg","Com_1161_neg","Com_2521_neg","Com_1201_neg","Com_2198_neg","Com_1125_neg","Com_886_neg","Com_759_neg","Com_766_neg","Com_1603_neg","Com_1247_neg","Com_853_neg","Com_1873_neg","Com_1997_neg","Com_1057_neg","Com_931_neg","Com_977_neg","Com_1649_neg","Com_2122_neg","Com_1546_neg","Com_2534_neg","Com_1435_neg","Com_982_neg","Com_2111_neg","Com_1314_neg","Com_1309_neg","Com_2446_neg","Com_1763_neg","Com_1493_neg","Com_1007_neg","Com_2001_neg","Com_1350_neg","Com_1781_neg","Com_628_neg","Com_1701_neg","Com_2243_neg","Com_2707_neg","Com_1287_neg","Com_1769_neg","Com_1160_neg","Com_1412_neg","Com_553_neg","Com_2504_neg","Com_1864_neg","Com_1799_neg","Com_644_neg","Com_707_neg","Com_1524_neg","Com_802_neg","Com_1633_neg","Com_1200_neg","Com_1662_neg","Com_868_neg","Com_2606_neg","Com_2626_neg","Com_2612_neg","Com_2559_neg","Com_1172_neg","Com_679_neg","Com_1776_neg","Com_1661_neg","Com_1028_neg","Com_890_neg","Com_971_neg","Com_1312_neg","Com_1218_neg","Com_1377_neg","Com_685_neg","Com_708_neg","Com_1062_neg","Com_743_neg","Com_1373_neg","Com_2622_neg","Com_2631_neg","Com_2601_neg","Com_2584_neg","Com_2487_neg","Com_2445_neg","Com_2417_neg","Com_2323_neg","Com_2153_neg","Com_2145_neg","Com_2105_neg","Com_2086_neg","Com_2082_neg","Com_2003_neg","Com_1931_neg","Com_1870_neg","Com_1859_neg","Com_1808_neg","Com_1795_neg","Com_1783_neg","Com_1702_neg","Com_1652_neg","Com_1534_neg","Com_1517_neg","Com_1451_neg","Com_1331_neg","Com_1178_neg","Com_968_neg","Com_837_neg","Com_808_neg","Com_619_neg","Com_602_neg","Com_609_neg","Com_586_neg","Com_570_neg","Com_547_neg","Com_2564_neg","Com_2552_neg","Com_2539_neg","Com_2527_neg","Com_2491_neg","Com_2293_neg","Com_2278_neg","Com_2247_neg","Com_2233_neg","Com_2076_neg","Com_2038_neg","Com_2028_neg","Com_1952_neg","Com_1940_neg","Com_1928_neg","Com_1851_neg","Com_1824_neg","Com_1813_neg","Com_1810_neg","Com_1775_neg","Com_1683_neg","Com_1635_neg","Com_1634_neg","Com_1584_neg","Com_1555_neg","Com_1516_neg","Com_1499_neg","Com_1504_neg","Com_1393_neg","Com_1351_neg","Com_1277_neg","Com_1250_neg","Com_1185_neg","Com_1189_neg","Com_1113_neg","Com_1145_neg","Com_1101_neg","Com_1023_neg","Com_954_neg","Com_959_neg","Com_950_neg","Com_881_neg","Com_888_neg","Com_863_neg","Com_852_neg","Com_856_neg","Com_749_neg","Com_668_neg","Com_676_neg","Com_2569_neg","Com_2470_neg","Com_2386_neg","Com_2250_neg","Com_2203_neg","Com_2156_neg","Com_2152_neg","Com_2124_neg","Com_1976_neg","Com_1933_neg","Com_1823_neg","Com_1773_neg","Com_1753_neg","Com_1737_neg","Com_1648_neg","Com_1640_neg","Com_1624_neg","Com_1602_neg","Com_1508_neg","Com_1410_neg","Com_1295_neg","Com_1274_neg","Com_1138_neg","Com_1119_neg","Com_1039_neg","Com_1010_neg","Com_748_neg","Com_713_neg","Com_655_neg","Com_627_neg","Com_613_neg","Com_600_neg","Com_555_neg","Com_550_neg","Com_552_neg","Com_648_neg","Com_652_neg","Com_73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