Next-Generation Sequencing-Based RiboMethSeq  Protocol for Analysis of tRNA 2'-O-Methylation.

ABSTRACT: Analysis of RNA modifications by traditional physico-chemical approaches is labor  intensive,  requires  substantial  amounts  of  input  material  and  only  allows  site-by-site  measurements.  The  recent  development  of  qualitative  and  quantitative  approaches  based  on   next-generation sequencing (NGS) opens new perspectives for the analysis of various cellular RNA  species.  The  Illumina  sequencing-based  RiboMethSeq  protocol  was  initially  developed  and  successfully applied for mapping of ribosomal RNA (rRNA) 2'-O-methylations. This method also  gives excellent results in the quantitative analysis of rRNA modifications in different species and  under varying growth conditions. However, until now, RiboMethSeq was only employed for rRNA,  and the whole sequencing and anal

SUBMITTER: Marchand V 

PROVIDER: S-EPMC5372725 | biostudies-literature | 2017 Feb

REPOSITORIES: biostudies-literature